يتضمن الهيكل " 6 " ( ست ) إدارات بالإضافة إلى قسم الشئون المالية والإدارية وإدارات ووحدات أخرى وهذه الإدارات والأقسام والوحدات هي :

1-إدارة التزويد والتبادل والإهداء : وتضم قسمين هما :

     أ-قسم التزويد: 

       يقوم بالعمل على تنمية مجموعات المقتنيات بالمكتبة واتخاذ الإجراءات الخاصة بالشراء

       وعمل إجراءات التسويات المالية والتسجيل بالسجلات الورقية والمحاسبية والمحافظـة

       عليها وتأمينها 

    ب_ قسم التبادل والإهداء:

    يقوم على عمليتي الإهداء والتبادل مع الجهات العلمية والثقافية وغيرها من الجهات .

2-إدارة الفهرسة والتصنيف والأدلـة:

مهمتها الإعداد الفني للمقتنيات كتب ورسائل الخ... من حيث الفهرسة والتصنيف ومتابعة الترتيب الموضوعي للموضوعات المختلفة

3- إدارة شئون مكتبات الكليات والمعاهد والمراكز: 

مهمتها متابعة العمل في مكتبات الكليات وتذليل العقبات التي تواجهها وتجميع الإحصائيات المختلفة عن المقتنيات بها وتبليغهم تباعاً بالمستجدات .

4-إدارة الرسائل الجامعية والبحـوث المكتبية :-

ومهمة هذه الإدارة استلام الرسائل العلمية والبحوث المكتبية من الباحثين وتسجيلها وختمها وكذلك تقديم الخدمة المكتبية والمرجعية للباحثين والمترددين كما تقوم هذه الإدارة بعمل إحصائيات للرسائل العربية والأجنبية الوارد إليها سنوياً وتضم هذه الإدارة مكتبة للبحوث العلمية وتقوم بتجميع بحوث السادة أعضاء هيئة التدريس ومعاونيهم والباحثين بجامعة دمياط والمقدمة للترقي منها ما هو باللغة العربية ومنها ما هو باللغة الأجنبية .

5-إدارة الخدمة المكتبية " كتب ، مراجع، دوريات ، مخطوطات وكتب نادرة " :

 مهمتها استقبال  المترددين من الباحثين وأعضاء هيئة التدريس والطلاب بجميع المراحل التعليمية واستلام المقتنيات الواردة إليها .

6-إدارة الوسائل السمعية والبصرية  :

ومهمتها الاستفادة من المقررات الدراسية والكتب العلمية المتخصصة بالسادة المترددين بواسطة الأجهزة المخصصة لذلك .

7- قسم الشئون المالية والإدارية : 

يقوم بتنفيذ  العمليات المالية والإدارية ومتابعتها لحين الانتهاء من تنفيذها .

8- وحدة التصوير :

مهمتها القيام  بعمليات التصوير للسادة المترددين